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Formado en las categorías inferiores del Granada C.F., la carrera de Notario transcurrió cerca de 10 temporadas por la categoría de bronce del fútbol español hasta que el Sevilla F.C., que entonces militaba en Segunda, se fijó en él y en la temporada 2000-2001 fue uno de los principales artífices del retorno de los sevillistas a Primera División.
Fue titular indiscutible las dos siguientes campañas, sin embargo el buen desempeño de su compañero Andrés Palop le relegó al banquillo. Tras seis años con los de Nervión se marchó al multimillonario Real Murcia de Jesús Samper con el que, después de otra temporada como fijo en las alineaciones, consiguió su segundo ascenso a Primera División.
En el verano de 2008 y tras una discreta campaña de los murcianos en Primera que supuso el descenso del equipo pimentonero, Notario rescinde su contrato y se compromete con el Celta de Vigo que entonces entrenaba Pepe Murcia.
En el verano de 2009 y a pesar de haber sido titular en 30 de los 42 partidos de la campaña anterior no entraba en los planes del técnico vigués Eusebio Sacristán y, rescindió su contrato para firmar por el Albacete.
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